En la clasificación sistemática e integradora de la Naturopatía se contemplan las posiblidades reales de desarrollo que tiene la Naturopatía como disciplina de carácter autónomo dentro del marco de las Ciencias de la Salud

No hay ciencia si tras una adecuada definición no aparece la enumeración sistemática de sus partes y dimensiones fundamentales que expliciten su riqueza interna, en nuestro caso la ciencia Naturopática también tiene su propia clasificación sistemática e integradora.

El cuerpo de estudio de la Naturopatía como ciencia de la salud, gira en torno a seis áreas de conocimiento que son:

• NATUROPATIA FUNDAMENTAL 
• NATUROPATIA DESCRIPTIVA 
• NATUROPATIA EXPERIMENTAL 
• NATUROPATIA NORMATIVA 
• SEMIOLOGÍA NATUROPÁTICA 
• NATUROPATÍA APLICADA O TECNOLOGÍA NATUROPÁTICA, que a su vez se compone de los siguientes módulos tecnológicos y praxiológicos.

1. Naturopatía Alimentaria o Trofologia
2. Naturopatia Fitocomplemetaria o Herbologia
3. Estimulos Naturales
4. Naturopatía Manual o Haptología
5. Naturopatía Energética
6. Naturopatía Sensorial
7. Naturopatía Psicofísica
8. Naturopatía Fucional
9. Naturopatía Ergásica

En esta clasificación sistemática e integradora de la Naturopatía se contemplan las posiblidades reales de desarrollo que tiene la Naturopatía como parcela de conocimiento autónomo, y la estructuración como un cuerpo de conocimiento con entidad propia dentro del campo de las Ciencias de la Salud.